PHREEQCを用いた化学反応解析の基礎

PHREEQCを用いた化学反応解析の基礎

PHREEQCは，USGSが作成した化学平衡計算等を行うソフトウェアです。
初めてPHREEQCを使う場面を想定して作成しています。
某大学で非常勤講師をしたときの資料を再整理したものです。

USGS の PHREEQC ホームページは こちら→。
PHREEQC のマニュアルは こちら→。
 

数式が乱れていましたので，PDFの資料に置き換えました。(240322)
資料はこちら（→）


このブログの人気の投稿

[MATLAB] 2.3 行列の要素を抽出する

2.3　行列の要素を抽出する 　5行×5列の行列を使い，行列の一部を抽出する例を示す。 (1)　1要素のみ >> C=magic(5) C = 17 24 1 8 15 23 5 7 14 16 4 6 13 20 22 10 12 19 21 3 11 18 25 2 9 >> C(2,4) ans = 14 図 2.10　行列要素の抽出例(1) 　上の例で “C(2,4)” は，「Cの2行目4列目の要素」を意味する。このように，MATLABにおいて行列要素の表記は「行列名（行,列）」となっている。 (2)　行要素全て >> C(1,:) ans = 17 24 1 8 15 図 2.11　行列要素の抽出例(2) 　“C(1,:)” は，「Cの1行目の要素全て」を意味する。括弧内の “1” が1行目，“:” は全ての列要素であることを示している。 (3) 列要素全て >> C(:,1) ans = 17 23 4 10 11 図 2.12　行列要素の抽出例(3) 　こちらの例では先の例と括弧内の順序が異なっており，1列目のみが抽出される。 (4)　複数の行要素全て 　次の例では，2行目と4行目の要素を全て抽出している。行の指定において “[2,4]” とすることで，同時に2つの行を指定している。 >> C([2,4],:) ans = 23 5 7 14 16 10 12 19 21 3 図 2.13　行列要素の抽出例(4) 　次の例では，行の指定を “2:5” としている。この場合，「2から5までの整数」という意味になる。つまり，2, 3, 4, 5行目を指定していることになる。 >> C(2:5,:) ans = 23 5 7 14 16
続きを読む

[MATLAB] A1 PAD (Problem Analysis Diagram)

イメージ
A1　PAD (Problem Analysis Diagram) 　プログラムの構造（アルゴリズム）を示す方法としてフローチャートが有名である。フローチャートは自由度が高く複雑な構造を表すことができる。しかしその一方で，複雑な構造になるほど線の数がおおくなり，プログラム構造が見にくくなる問題点がある。また，同じ構造でも違う図式で書けてしまうという問題点もある。 　PAD は，1979年に開発された方法で，プログラムの構造が見やすい，図式からのコーディングが容易であるなどの特長を有する 1 。 図 A1　PADの表記法 　例として，1から10までの整数の和を計算し，足している数が奇数なら“odd number”，偶数なら“even number”と出力するプログラムと，それをPADで表したものを示す。PADにおいて，プログラムは上方から下方に向けて処理が実行されることを示している。 total=0; 　… ① for i=1:10　… ② total = total + i; 　… ③ if (rem(i,2)==1) 　… ④ disp('odd number'); 　… ⑤ else disp('even number'); 　… ⑥ end end disp(total); 　… ⑦ 図 A2　サンプルプログラム 図 A3　サンプルプログラムのPAD 二村良彦, 1986. PADの開発. 日立評論 5, 7-11. ↩︎
続きを読む

[MATLAB] 3.3 解析

イメージ
3.3　解析 　ここでは，水温と溶存酸素濃度 (DO) との間に相関関係があるかどうかを確認してみる。 (1)　水温とDOとの関係をグラフで確認する 1) 全てのデータでグラフを作成する plot(WT(:),DO(:),'o'); xlabel('WT'); ylabel('DO'); [↵] 図 3.3　水温とDOとの関連性 　データはばらついているものの，水温とDOとの間にはなんらかの関係がありそうな雰囲気がある。ただ，この図では全ての水深のデータを一度にプロットしているので，傾向がはっきりしない。 2) 水深ごとに色を変えて表示してみる plot(WT,DO,'o'); xlabel('WT'); ylabel('DO'); [↵] legend(['01'; '02'; '03'; '04'; '05'; '06'; '07'; '08'; '09'; '10']) ; [↵] 図 3.4　水温とDOとの関連性 （水深別に色分け） 　水温とDOとの関係は，水深によってはっきりと異なること，水深によっては水温とDOとの間に相関関係がありそうなことがわかる。 3) 水深ごとに別々のグラフを作成する for k=1:10, subplot(4,3,k); plot(WT(:,k),DO(:,k),'o'); title(num2str(k)); end [↵] 図 3.5　水深ごとの水温とDOとの関連性 　水深の浅い地点で，水温とDOとの間に負の相関関係がはっきりと表れている。 (2)　相関係数を確認する 1) 相関関係を求める 　最も浅い水深での水温とDOとの相関係数を求めてみる： corrcoef(WT(:,1), DO(:,1)) [↵] → 以下の通り出力される。ansの1行目1列目，2行目2列目はそれぞれWT(:,1)，DO(:,1)同士の相関係数で，通常は1になる。1行目2列目，2行目1列目が
続きを読む